在合肥注册物流公司，先要办理道路运输许可证，然后办理工商注册。
一、申办物流企业的条件
1、注册资金：100万以上；
2、办公场所：200㎡以上；
3、仓储：2000㎡以上
4、从业人员：5人以上
5、车辆：5台以上
二、办理道路运输许可需要的材料
1、申请项目的可行性报告，并注明 经营范围；
2、《道路运输站（场）经营申请表》；
3、负责人身份证，经办人身份证和委托书；
4、经营道路货运站（场）的土地、房屋的合法证明；
5、货运站（场）竣工验收证明；
6、与业务相适应的专业人员和管理人员的身份证、专业证书；
7、业务操作规程和安全生产管理制度文本；
8、资金信用证明或资产评估机构的验资证明；
9、企业章程文本；
10、工商机关签发的工商营业执照或“企业名称预核准通知书”；
11、法律、法规和规章规定的其他材料。